数ヶ月前に基本情報に受かりました。
まだ学生で実務経験もないので焦らず勉強するつもりなのですが今から応用情報に間に合う自信がないので諦めてこっちを目指して勉強したいです

この場合参考書などはまず応用情報を買って勉強するべきでしょうか
2年くらい目安に勉強したいのですが基本情報受かって次に勉強するのにおすすめの参考書とかあれば教えてください

スキップ受験はその分野の実務経験者が受験する想定で用意されている道筋のはずです。
未経験ならAPやその後継試験のレベルが実務でもやれるなら有能扱いされるでしょう。